GeneSoC® アプリケーションノート [検出例]

◯ 細菌

百日咳マクロライド耐性菌遺伝子の検出【所要時間:約13分】

百日咳菌(Bordetella pertussis)のマクロライド耐性に関与する遺伝子(23S rRNA の1遺伝子変異:A2047G)を、超高速リアルタイムPCRで検出しました。【所要時間:約13分】

○ 使用機器、及び試薬

  • GeneSoC® mini R
  • GeneSoC® mini 専用測定チップ
  • CycleavePCRTM Reaction Mix (CY505A, タカラバイオ株式会社)

○ プライマー及びプローブ

病原体検出マニュアル「百日咳」第4.0版(出典:国立健康危機管理研究機構 感染症情報提供サイトホームページ) (3)-9 マクロライド耐性菌の検出 A2047G-cycleave PCR法を参照

○ 測定サンプル

変異型(A2047G)及び野生型(A2047)のDNA断片を添加した水溶液

○ 測定プロトコール 【所要時間:約13分】

温度(°C) 時間(sec) Cycle
HS 98 10 1
DN 98 3 50
AE 57 9

(所要時間:約13分)

  • HS:Hot Start
  • DN:Denature
  • AE:Annealing / Extension

※より詳細な実験条件につきましては、弊社担当までお問い合わせください。

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